Die Programme der Maulwerker umfassen neben den Schwerpunkten FLUXUS, CAGE und SCHNEBEL die Reihen maulwerker performing music und ORTE + RÄUME.

maulwerker performing music (mpm) wird seit 2005 von Christian Kesten konzipiert und findet seit 2017 im Ballhaus Ost statt. Es handelt sich um performative Konzertprogramme mit thematischem Fokus, die das bestehende Repertoire der Maulwerker durch Uraufführungen von Werken zeitgenössischer Komponist*innen erweitert. Diese Reihe wird hauptsächlich durch Förderungen der initiative neue musik Berlin (inm) ermöglicht.
Die Programme dauern ca. 80 Minuten und werden auch als Gastspiele in der Regel mit 5 - 6 Performern angeboten.

Die Reihe Orte + Räume entstand 2021 in Reaktion auf die Pandemie. Ortbezogene Musik unter freiem Himmel – vom Ensemble selbst konzipiert und unter Mitwirkung von Gästen – ist ein experimentelles Format, das bisher verschiedene Höfe im Berliner Stadtraum bespielte.